Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms