Protein–RNA interactions for Protein: Q5T447

HECTD3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD3Q5T447 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HECTD3Q5T447 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HECTD3Q5T447 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HECTD3Q5T447 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms