Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C1orf220Q5T0J3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C1orf220Q5T0J3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms