Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C10orf55Q5SWW7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C10orf55Q5SWW7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms