Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms