Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO47Q5MNV8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO47Q5MNV8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms