Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
SAMD9Q5K651 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SAMD9Q5K651 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SAMD9Q5K651 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms