Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC27A3Q5K4L6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC27A3Q5K4L6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms