Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RUNDC3AQ59EK9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RUNDC3AQ59EK9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms