Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SGO2Q562F6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms