Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDCA8Q53HL2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDCA8Q53HL2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms