Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KLHL22Q53GT1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms