Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC184Q52MB2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC184Q52MB2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms