Protein–RNA interactions for Protein: Q4V348

ZNF658B, Zinc finger protein 658B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF658BQ4V348 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF658BQ4V348 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF658BQ4V348 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms