Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
RNF212Q495C1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RNF212Q495C1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms