Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC153Q494R4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms