Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF260Q3ZCT1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF260Q3ZCT1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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