Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EDRF1Q3B7T1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EDRF1Q3B7T1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms