Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPK5

CTU2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2Q2VPK5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CTU2Q2VPK5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTU2Q2VPK5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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