Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSR1Q2NL82 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSR1Q2NL82 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms