Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM1Q2NKQ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM1Q2NKQ1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM1Q2NKQ1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM1Q2NKQ1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM1Q2NKQ1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM1Q2NKQ1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGSM1Q2NKQ1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SGSM1Q2NKQ1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGSM1Q2NKQ1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms