Protein–RNA interactions for Protein: Q29980

MICB, MHC class I polypeptide-related sequence B, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICBQ29980 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MICBQ29980 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MICBQ29980 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
MICBQ29980 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MICBQ29980 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MICBQ29980 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
MICBQ29980 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
MICBQ29980 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MICBQ29980 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MICBQ29980 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MICBQ29980 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICBQ29980 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MICBQ29980 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms