Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SWI5Q1ZZU3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SWI5Q1ZZU3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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