Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MSMPQ1L6U9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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