Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
KNOP1Q1ED39 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KNOP1Q1ED39 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KNOP1Q1ED39 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms