Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COL24A1Q17RW2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
COL24A1Q17RW2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL24A1Q17RW2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms