Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK4Q16654 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK4Q16654 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDK4Q16654 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK4Q16654 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PDK4Q16654 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDK4Q16654 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK4Q16654 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK4Q16654 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK4Q16654 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDK4Q16654 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK4Q16654 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK4Q16654 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK4Q16654 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDK4Q16654 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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