Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFIL3Q16649 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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NFIL3Q16649 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFIL3Q16649 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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