Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GABRA6Q16445 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GABRA6Q16445 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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