Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NTRK3Q16288 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NTRK3Q16288 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NTRK3Q16288 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
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