Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ZFHX3Q15911 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZFHX3Q15911 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
ZFHX3Q15911 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZFHX3Q15911 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ZFHX3Q15911 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms