Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD3Q15059 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD3Q15059 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
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