Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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RAB39AQ14964 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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RAB39AQ14964 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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RAB39AQ14964 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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RAB39AQ14964 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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RAB39AQ14964 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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RAB39AQ14964 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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RAB39AQ14964 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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RAB39AQ14964 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RAB39AQ14964 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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RAB39AQ14964 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
RAB39AQ14964 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB39AQ14964 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB39AQ14964 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB39AQ14964 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB39AQ14964 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB39AQ14964 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
RAB39AQ14964 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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