Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MDC1Q14676 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
MDC1Q14676 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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