Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
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IRF3Q14653 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
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IRF3Q14653 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IRF3Q14653 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IRF3Q14653 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
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