Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
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GBX1Q14549 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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GBX1Q14549 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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GBX1Q14549 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GBX1Q14549 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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GBX1Q14549 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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GBX1Q14549 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GBX1Q14549 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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