Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SQLEQ14534 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SQLEQ14534 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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