Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEDD9Q14511 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEDD9Q14511 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
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