Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PDE6HQ13956 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PDE6HQ13956 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PDE6HQ13956 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PDE6HQ13956 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PDE6HQ13956 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PDE6HQ13956 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PDE6HQ13956 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PDE6HQ13956 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6HQ13956 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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