Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PDE7AQ13946 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7AQ13946 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms