Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
EIF4EBP1Q13541 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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