Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BFSP2Q13515 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BFSP2Q13515 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms