Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PICALMQ13492 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PICALMQ13492 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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