Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TCIRG1Q13488 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TCIRG1Q13488 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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