Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED1Q13445 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMED1Q13445 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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TMED1Q13445 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED1Q13445 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TMED1Q13445 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED1Q13445 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TMED1Q13445 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED1Q13445 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMED1Q13445 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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TMED1Q13445 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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TMED1Q13445 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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TMED1Q13445 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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TMED1Q13445 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TMED1Q13445 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TMED1Q13445 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
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TMED1Q13445 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMED1Q13445 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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