Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MKRN4PQ13434 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN4PQ13434 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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