Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SGCGQ13326 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SGCGQ13326 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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SGCGQ13326 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SGCGQ13326 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGCGQ13326 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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