Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRDNQ13061 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TRDNQ13061 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
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