Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NFX1Q12986 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NFX1Q12986 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
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