Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PTPN13Q12923 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PTPN13Q12923 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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